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研究人员破解核桃基因组

导读 加利福尼亚州生产99%的美国核桃。新的研究可以为该州16亿美元核桃产业的发展提供重要推动力,使核桃树更容易养殖,以更好地抵抗目前困扰加...

加利福尼亚州生产99%的美国核桃。新的研究可以为该州16亿美元核桃产业的发展提供重要推动力,使核桃树更容易养殖,以更好地抵抗目前困扰加州4,800名种植者的土壤病原体。

在一项新的研究中,加利福尼亚大学戴维斯分校和美国农业部农业研究局(ARS)的科学家小组利用一种独特的方法对英国核桃及其野生北美亲属的基因组进行测序,并利用两种能力。最先进的技术:长读DNA测序和光学基因组图谱。所产生的基因组序列被认为是任何木本多年生植物组装的最高质量。

“通过对核桃杂交种的基因组进行测序,我们在通常生产一个基因组序列所需的时间内为父母制作了完整的基因组序列,”该项目的主要基因组学调查员和研究遗传学家罗明成说。加州大学戴维斯分校植物科学系。

这种方法可以应用于树木和许多其他木本多年生植物的基因组测序,为更好地了解杏仁,山核桃,开心果和葡萄的基因蓝图打开了大门。

“就像核桃一样,这些其他作物自然地交叉授粉,因此变化很大,”加州大学戴维斯分校植物科学系联合首席研究员和遗传学教授Jan Dvorak说。“可变性总是大大增加了我们为这些作物生产高质量基因组序列的能力,但这些新技术现在使它成为可能,”Dvorak补充说。

在加利福尼亚州,核桃是使用砧木种植的,这些砧木专门根据其耐受各种土传疾病的能力而选择。

“我们选择将广泛使用的英国核桃与野生德克萨斯黑核桃杂交,因为它对几种土传疾病和根系线虫具有天然抗性,这是加利福尼亚核桃的严重害虫,”美国农业部ARS的Dan Kluepfel说道。核桃 - 砧木开发项目的科学家和首席研究员。

两个核桃品种的组装基因组序列现在也将帮助研究人员确定育种者可以用来开发具有改善的病原体和害虫抗性的新品种的遗传标记。

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