延时显微镜的新图像分析方法可显示巨型病毒如何感染变形虫
病毒可能是我们所知道的最奇特的“生命形式”,每种物种都具有独特的特征。所有病毒的共同点是,它们攻击“宿主”细胞并劫持其机器,并将其用于自己的复制。一种称为“巨型病毒”的大型病毒,具有有趣的攻击宿主生物变形虫的方法。
病毒学家一直试图了解是什么使这些病毒如此独特,但要观察它们,需要复杂的技术。通常使用一种称为相差显微镜的方法来研究所有类型的细胞,包括变形虫细胞。但是,这项技术在很大程度上依赖于细胞状况及其背景的变化,有时这会导致所生成图像的破坏,例如“晕”(其中的单元格被明亮的光线包围)和“阴影”(其中的单元格内部和背景强度相似)。这就是为什么要更深入地了解巨型病毒如何感染变形虫细胞,需要更有效的细胞跟踪技术。本月早些时候,由东京科学大学的科学家武村正治(Masaharu Takemura)教授领导了报道说,从日本的河岸发现了两种新的潘多拉病毒和伪病毒,这两种病毒都感染变形虫。Takemura教授说,从了解巨型病毒的生态学角度出发,不断从土壤中发现病毒至关重要。
更重要的是,在一次由微生物科学前沿发表的全新研究中,东京科学大学的一组科学家再次由Takemura教授领导,试图了解变形虫细胞感染不同类型巨病毒的行为。为此,他们设计了一种新的细胞跟踪方法,以解决常规分析方法的问题。Takemura教授详细阐述了这项研究的动机:“我们的目的是了解巨型病毒如何感染自然环境中的变形虫,以及这如何影响真核生物的进化。为此,我们希望开发一种定量检测时间的技术,细胞数量,大小,形状以及细胞运动的方向和距离的依赖性,顺序变化。”
在他们的研究中,竹村教授和他的团队研究了被一种名为“马赛病毒”的巨型病毒感染的变形虫。为了了解感染了这种特定类型病毒的宿主细胞的行为,科学家开发了一种新算法,该算法可以使用时移相差显微镜图像追踪变形虫种群中的单个变形虫细胞。他们将该算法命名为“基于变形的变形虫动力学分析算法”或PKA3。科学家使用PKA3揭示了变形虫如何应对巨大的病毒攻击的有趣的新方面。例如,他们定量显示感染巨病毒的变形虫细胞形成聚集体或“束”。他们推断这可能是宿主的抗病毒策略,也可能是病毒的传播方式,阐明病毒感染的发生方式。而且,与传统方法相比,他们设法更快地检测出细胞数目的变化和受马赛病毒感染的变形虫的出现。有趣的是,他们还可以分析变形虫应对病毒感染所花费的时间,从而提供关于变形虫和病毒的生命周期以及它们之间的关系的有用信息。Takemura教授说:“我们的算法成功地观察了相差显微镜产生的图像中细胞的运动,该方法是细胞生物学中广泛使用的一种方法。它还可以量化各种参数。这项研究将极大地有助于对变形虫感染了这种巨型病毒。”他们设法比传统方法更快地检测出细胞数量的变化和受马赛病毒感染的变形虫的出现。有趣的是,他们还可以分析变形虫应对病毒感染所花费的时间,从而提供关于变形虫和病毒的生命周期以及它们之间的关系的有用信息。Takemura教授说:“我们的算法成功地观察了相差显微镜产生的图像中细胞的运动,该方法是细胞生物学中广泛使用的一种方法。它还可以量化各种参数。这项研究将极大地有助于对变形虫感染了这种巨型病毒。”他们设法比传统方法更快地检测出细胞数量的变化和受马赛病毒感染的变形虫的出现。有趣的是,他们还可以分析变形虫应对病毒感染所花费的时间,从而提供关于变形虫和病毒的生命周期以及它们之间的关系的有用信息。Takemura教授说:“我们的算法成功地观察了相差显微镜产生的图像中细胞的运动,该方法是细胞生物学中广泛使用的一种方法。它还可以量化各种参数。这项研究将极大地有助于对变形虫感染了这种巨型病毒。”他们还可以分析变形虫应对病毒感染所花费的时间,从而提供关于变形虫和病毒的生命周期以及它们之间的关系的有用信息。Takemura教授说:“我们的算法成功地观察了相差显微镜产生的图像中细胞的运动,该方法是细胞生物学中广泛使用的一种方法。它还可以量化各种参数。这项研究将极大地有助于对变形虫感染了这种巨型病毒。”他们还可以分析变形虫应对病毒感染所花费的时间,从而提供关于变形虫和病毒的生命周期以及它们之间的关系的有用信息。Takemura教授说:“我们的算法成功地观察了相差显微镜产生的图像中细胞的运动,该方法是细胞生物学中广泛使用的一种方法。它还可以量化各种参数。这项研究将极大地有助于对变形虫感染了这种巨型病毒。”一种广泛用于细胞生物学的方法。而且,它允许量化各种参数。这项研究将极大地证明被巨病毒感染的变形虫的行为。”一种广泛用于细胞生物学的方法。而且,它允许量化各种参数。这项研究将极大地证明被巨病毒感染的变形虫的行为。”