来自里尔感染与免疫中心(CNRS / INSERM /里尔巴斯德研究所/里尔大学/楚里尔)，INRAE和来自巴西(贝洛奥里藏特)，苏格兰(格拉斯哥)和丹麦(哥本哈根)实验室的研究人员已经证明了这一点。首次在小鼠中发现流感病毒引起的肠道菌群扰动有利于继发细菌的二次感染。这些结果发表在2020年3月3日的细胞报告中，为预防和治疗细菌性肺炎开辟了新的前景，细菌性肺炎是感染流感病毒的老年人或脆弱人群的主要死亡原因。

流感及其并发症仍然是重大的公共卫生问题，也是重大的社会和经济负担。疫苗接种运动以及新抗病毒疗法的发现为预防和治疗提供了解决方案。然而，抵抗继发性细菌感染的防御机制的损害仍然是一个主要问题，这种损害大大恶化了流感患者的临床状况。

里尔感染与免疫中心的CNRS研究人员FrançoisTrottein领导的团队专注于肺部免疫，研究小组专注于肠道菌群，该菌群在许多生理过程(包括免疫防御机制)中起着关键作用。科学家表明，在老鼠中，流感会暂时改变肠道菌群的组成和代谢活性，这可能是由于生病期间食物消耗减少所致。在流感期间，微生物群细菌产生的短链脂肪酸也减少了。该研究小组现已表明，这些脂肪酸远距离有利于肺中巨噬细胞的杀菌活性。因此，流感对肠道菌群的干扰会损害肺部防御能力，尤其是针对肺炎链球菌的防御能力，

研究人员还表明，对细菌过度感染的敏感性可以通过用醋酸盐处理来纠正，醋酸盐是微生物群产生的主要短链脂肪酸之一。他们的工作可以为感染患者的福祉提供实际应用，可以更好地保护他们免受流感相关并发症的伤害。这项工作是与Micalis研究所(INRAE / AgroParistech / Saclay大学)，里尔炎症研究国际中心(INSERM /里尔大学/ CHU里尔)，生物活性分子设计和应用实验室(CNRS /斯特拉斯堡大学)，分子病毒学和免疫学系(INRAE)和GenoScreen(里尔)，米纳斯吉拉斯州联邦大学(巴西贝洛哈里桑塔)，分子研究所，细胞和系统生物学(苏格兰格拉斯哥)和药理学系(丹麦哥本哈根大学)。这一发现代表了对流感患者细菌超级感染背后机制的理解的重大突破。它可能导致开发新的营养和/或治疗策略，以更好地控制细菌感染。