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来自38个不同类型癌症患者的2600多个肿瘤样本的DNA

导读 世界卫生组织(WHO)估计,所有癌症中有15%以上直接或间接归因于传染性病原体。里昂国际癌症研究机构(IARC)已将11种不同的病原体(病毒,细菌...

世界卫生组织(WHO)估计,所有癌症中有15%以上直接或间接归因于传染性病原体。里昂国际癌症研究机构(IARC)已将11种不同的病原体(病毒,细菌和蠕虫)归为致癌物质,并估计十分之一的癌症与病毒有关。全世界每年仅由人乳头瘤病毒(HPV)引起的癌症就有640,000种。

由德国癌症研究中心(DKFZ)的彼得·利希特(Peter Lichter)领导的国际基因组研究人员团队现已发表了一篇新论文,以提供有关哪些病毒在哪些癌症中起作用的精确概述。研究人员还寻找了以前与致癌作用甚至完全未知的病毒。本研究的主要作者,DKFZ的马克·扎帕特卡(Marc Zapatka)解释说:“与癌症有关的病毒问题与医学密切相关。”“由于与病毒有关的癌症,真正的预防是可能的:如果发现了致癌病毒,就有机会避免被疫苗感染,从而预防癌症的发展。”

目前的工作是泛癌全基因组分析(PCAWG)的一部分,该联盟由1300多名研究人员组成,旨在确定哪些基因突变或DNA突变模式在几种类型的肿瘤中起作用。为了进行这项荟萃分析,他们对来自38种不同类型癌症的2600多个肿瘤基因组的测序数据进行了全面的生物信息学分析。

DFKZ小组在356名癌症患者中发现了总共23种不同病毒类型的痕迹。不出所料,最常见的已知肿瘤引发和生长的病毒驱动因素是:爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)的基因组,已知会引起多种不同类型的癌症,尤其是淋巴瘤,胃和鼻咽癌;被调查的癌症基因组中有5.5%被发现。在330例肝癌中有62例发现了乙肝病毒(HBV)DNA。

研究人员主要在宫颈癌(研究的20例癌症病例中的19例)和头颈部肿瘤(57例中的18例)中发现了人类乳头瘤病毒,最常见的是HPV16。

他们能够排除与癌症的联系,因为对于某些检测到的病毒类型而言,这种联系的可能性很小。因此,例如,腺病毒和杆状病毒通常在分子生物学领域中用作研究工具,因此发现的序列可能是由于污染造成的。

在少数情况下,研究小组发现了其他已知会引起癌症的病毒,例如肾癌中的逆转录病毒。有时在正常感染的组织类型的肿瘤中发现其他病原体,例如胃癌中的巨细胞病毒。尽管进行了全面的生物信息学分析,但是研究人员并未发现任何完全未知的病毒。

在一些与HPV和EBV相关的肿瘤中,研究人员观察到,这些癌症类型的细胞正常生长所依赖的特征性驱动基因突变缺失了:病毒的存在可能通过其他因素支持了恶性细胞的变性。

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