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鉴定了40种新的视网膜神经节细胞亚型

导读 细胞测序技术正在填写生活目录中的精细细节。康涅狄格州健康和杰克逊实验室(JAX)的研究人员已经确定了40种视网膜神经节细胞亚型(RGCs)以及

细胞测序技术正在填写生活目录中的精细细节。康涅狄格州健康和杰克逊实验室(JAX)的研究人员已经确定了40种视网膜神经节细胞亚型(RGCs)以及区分它们的遗传标记和转录因子。

由于基于液滴的单细胞RNA测序技术的最新进展,研究人员现在可以分离单个细胞并扩增其遗传物质以探测其完整的RNA。这使得可以对给定类型的细胞(例如,RGC)进行详细的普查,从而识别构成亚型的细微分子差异。

RGC将视觉数据从眼睛传递到大脑,之前已经确定了30种亚型。使用单细胞RNA测序,研究小组分析了6,225个RGC,从新生小鼠的左眼和右眼检测到每个细胞表达的约5,000个基因。通过聚类算法运行结果数据导致细胞分为40个亚型。

哺乳动物中枢神经系统非常复杂,涉及许多特殊神经元类型和亚型的相互作用。研究小组之所以选择RGC正是因为与其他主要神经元细胞类型相比,迄今为止已经确定了其更多的亚型,并且因为其他广泛类型的视网膜细胞类型(如光感受器)已经在单细胞水平上进行了研究。他们的目标是阐明RGC亚型之间的分子差异和独特的标记。

除了鉴定新的RGC亚型及其标记外,研究人员还证明了将细胞分化为亚型所需的细胞之间基因表达变异的数量,并呈现从细胞类型群体到亚型的层次结构。该研究的数据集可通过用户友好的UConn Health Web应用程序RGC Subtypes Gene Browser公开获得。

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