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25个英国物种的基因组首次测序

导读 Wellcome Sanger研究所的科学家及其合作者首次阅读了25种英国物种的基因组。今天(10月4日)在桑格研究所成立25周年之际宣布的25个已完成的...

Wellcome Sanger研究所的科学家及其合作者首次阅读了25种英国物种的基因组。今天(10月4日)在桑格研究所成立25周年之际宣布的25个已完成的基因组序列将导致未来的研究,以了解英国的生物多样性,并帮助保护和理解我们的物种。

新测序的基因组将能够研究为什么一些褐鳟迁移到开阔的海洋,而另一些则没有,或研究知更鸟眼中的磁感受器,让他们“看到”地球的磁场。基因组还可以帮助揭示为什么红松鼠容易受到松鼠痘病毒的攻击,但灰松鼠可以携带并传播病毒而不会生病。

桑格研究所由Sir John Sulston教授于1993年创立,作为人类基因组计划的一部分。该研究所对第一个人类基因组的金标准序列作出了最大的单一贡献,该序列于2003年出版。

基因组是生物体用DNA编写的完整遗传指令集。每个基因组都包含构建该生物体并使其生长和发育所需的所有信息。

自人类基因组标志性建成以来,桑格研究所已成为全球公认的基因组学领域的领导者。许多更重要的参考基因组已经被测序 - 从小鼠和斑马鱼基因组到猪,大猩猩,蚊子和许多其他基因组。除动物物种外,传染病和细菌在参考基因组列表中也占有突出地位,从沙门氏菌和MRSA到衣原体和疟疾。所有这些都提供了关于这些物种在健康和疾病方面的重要见解。

现在,桑格研究所及其合作伙伴首次对25种英国物种进行了全面测序。第一个人类基因组需要13年和数十亿美元才能完成。随着技术的巨大进步和测序成本的下降,科学家们能够在不到一年的时间内对25种物种的基因组进行新的测序,而且成本只是其中的一小部分。

桑格研究所副主任朱莉娅威尔逊博士说:“我们很高兴地宣布完成了来自英国物种的25个基因组。这些物种首次测序并非没有挑战,但我们的科学家和工作人员反复提出我们已经通过这个项目学到了很多知识,这些新知识正在流入我们大规模科学的许多领域。现在已经阅读了基因组,每个物种难题的各个部分需要重新组合在一起。在基因组装配之前,它们是可用的。“

桑格25基因组计划的协调员Dan Mead说:“我们已经发现了这些物种在其基因组中存在的令人惊讶的秘密。我们发现King扇贝在遗传上比我们更加多样化,而且Roesel的丛林板球基因组它是人类基因组大小的四倍。与人类基因组计划首次开始时类似,我们不知道这些发现可能带给我们什么。“

PacBio®长读序列技术使25基因组计划成为可能,该技术可生成高质量的基因组。该研究所与PacBio和技术领域的其他领导者10x Genomics和Illumina合作,创建了这些基因组的最全面的视图。

高质量的基因组将免费提供给科学家用于他们的研究。研究人员可以发现英国物种如何应对环境压力,以及它们在遗传学中保持什么秘密,使它们能够蓬勃发展或挣扎。

伦敦自然历史博物馆生命科学负责人兼25 Genomes项目合作伙伴Tim Littlewood博士说:“25基因组计划揭示了英国多元化生活的蓝图,它将有效地重写我们所知道的关于这些物种。通过比较物种内和物种之间的蓝图,我们可以了解来自英国及其他地区的动植物的遗传多样性。这些新测序的基因组是一个起点,它将揭示我们甚至没有梦想过的进化方面。 “。

该项目对一项更大规模的工作做出了很小的贡献,来自世界各地的科学家们聚集在一起制定了一个计划,对地球上的所有生命进行排序。

桑格研究所所长迈克斯特拉顿教授说:“DNA测序技术在过去几年中已经取得了进展,我们至少可以讨论对地球上所​​有生命基因组进行测序的可能性。 DNA序列我们将获得关于进化如何发挥作用以及生命如何发挥作用的不可估量的见解。“

对其基因组进行测序的25种物种是:

蓬勃发展的物种:

灰松鼠

小环蝴蝶

罗塞尔的丛林板球

牛津狗舌草

萎靡的物种:

红松鼠

水田鼠

龟鸽子

北二月红色石蝇

危险物种:

巨人hogweed

印度香脂

King扇贝,又名Great scallop,Coquilles Saint-Jacques

新西兰扁虫

标志性物种:

金鹰

黑莓

欧洲知更鸟

红色梅森蜜蜂

隐秘物种:

褐鳟鱼

常见的pipistrelle蝙蝠

卡林顿的羽毛

夏天松露

公众选择的五种:

常见的海星

芬筏蜘蛛

小斑点猫鲨

亚洲大黄蜂

欧亚水獭

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