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按层析原理还可将层析分为：凝胶层析、离子交换层析、高效液相层析、亲和层析。

1.凝胶层析

又称分子筛过滤或排阻层析等。

固定相是多孔凝胶，各组分的分子大小不同，因而在凝胶上受阻滞的程度(移动速度)也不同。

优点：所用凝胶属于惰性载体，吸附力弱，操作条件温和，不需要有机溶剂，对高分子物质有很好的分离效果。

常用的凝胶有Sephadex G(葡聚糖凝胶)系列。

凝胶层析可用于脱盐、分离提纯、测定高分子物质的分子量、高分子溶液的浓缩等。

2.离子交换层析

采用具有离子交换性能的物质作固定相，利用它与流动相中的离子能进行可逆交换的性质来分离离子型化合物的方法。

主要用于分离氨基酸、多肽及蛋白质，也可用于分离核酸、核苷酸及其他带电荷的生物分子。

3.高效液相层析

在经典液相层析法基础上，引进气相层析的理论而发展起来的一项新颖快速的分离技术。

具有分离能力强、测定灵敏度高、可在室温下进行、应用范围广等优点，对分离蛋白质、核酸、氨基酸、生物碱、类固醇和类脂等尤其有利。

根据流动相和固定相相对极性，高效液相色谱分析可分为正相和反相两种。

4.亲和层析

利用待分离物质和它的特异性配体间具有特异的亲和力，从而达到分离的目的。

将可亲和的一对分子中的一方以共价键形式与不溶性载体相连作为固定相吸附剂，当含混合组分的样品通过此固定相时，只有和固定相分子有特异亲和力的物质才能被固定相吸附结合，无关组分随流动相流出。

改变流动相组分，可将结合的亲和物洗脱下来。

亲和层析中所用的载体称为基质，与基质共价连接的化合物称配基。

具有专一亲和力的生物分子对主要有：

抗原与抗体，DNA与互补DNA或RNA，酶与底物，激素与受体，维生素与特异结合蛋白，糖蛋白与植物凝集素等。

亲和层析可用于纯化生物大分子、稀释液的浓缩、不稳定蛋白质的贮藏、分离核酸等。

延伸阅读：

层析法是利用待分离物质中不同组分的某些理化性质的差异而建立起来的一种分离技术。所有的层析系统均是由固定相和流动相组成，固定相为固体物质或固定于固体物质上的成分，流动相是可以流动的物质如水和各种溶剂。 [1]

在1903-1906年由俄国植物学家M. Tswett首先提出

将叶绿素的石油醚溶液通过CaCO3管柱，并继续以石油醚淋洗，由于CaCO3对叶绿素中各种色素的吸附能力不同，色素被逐渐分离，在管柱中出现了不同颜色的谱带或称色谱图

层析法是利用混合物中各组成部分物理化学性质的差异(如吸附力,分子形状及大小,分子亲和力,分配系数等),使各组成部分在两相(一相为固定的,称为固定相;另一相流过固定相,称为流动相)中的分布程度不同,从而使各组成部分以不同的速度移动而达到分离的目的.