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只需几分钟即可获得蛋白质指纹的新技术

柏林Charité大学和弗朗西斯·克里克研究所的研究人员开发了一种基于质谱的技术,能够在短短几分钟内测量包含数千种蛋白质的样品。它比常规的血球计数更快,更便宜。

为了证明这项技术的潜力,研究人员使用了从COVID-19患者身上收集的血浆。他们使用新技术鉴定了11种以前未知的蛋白,这些蛋白是疾病严重程度的标志。该研究成果已发表在《自然生物技术》上。

在任何给定时间,成千上万种蛋白质在人体内都是活跃的,提供其结构并使生命必不可少的反应得以实现。人体可以根据需要提高和降低特定蛋白质的活性水平,包括对病原体和药物等外部因素做出反应时。因此,在细胞,组织和血液样本中发现的蛋白质的详细模式可以帮助研究人员更好地了解疾病或进行诊断和预后。

为了获得这种“蛋白质指纹”,研究人员使用了质谱仪,这是一种既费时又费钱的技术。一种基于质谱的新技术“ Scanning SWATH”有望改变这一现状。该技术是在Charité生物化学研究所所长Markus Ralser教授的领导下开发的,该技术比以前的方法更快,更具成本效益,使研究人员每天可以测量数百个样品。

“同时,我们还改变了质谱仪的电场,以加快这项技术的发展。所产生的数据极其复杂,以至于人们无法再对其进行分析。”同时也是弗朗西斯大学集团负责人的爱因斯坦教授拉尔瑟教授解释说。伦敦克里克学院。他补充说:“因此,我们开发了基于神经网络的计算机算法,并使用这些数据提取相关的生物学信息。这使我们能够并行识别数千种蛋白质,并大大减少了测量时间。幸运的是,这种方法还具有更多优势。精确的。”

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