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研究人员对栽培花生的基因组进行序列分析

像许多其他作物一样,栽培花生是杂交起源的,并且具有多倍体基因组,其基本上包含来自两个祖先物种的完整染色体组:Arachisduranensis和A. ipaensis。

它的故事在南美,在那里开始了几千年前A. duranensis和A. ipaensis基因组中一个罕见的遗传事件合并。结果是复杂的基因组混合物几乎与人类基因组一样大,约为30亿个碱基对。

最初,格鲁吉亚科学家David Bertioli和同事的大学测序的基因组A. duranensis和A. ipaensis分开,使用来自两个物种,而不是从种植花生取DNA。这使得更容易识别基因组的结构特征和驻留在它们上的基因。研究人员在2016年的“自然遗传学”杂志上报告了这一进展。

现在,使用先进的DNA测序设备,该团队已经在一个商业种植的花生中对两个合并的基因组进行了测序,即“Tifrunner”,填补了之前努力遗漏的知识空白。

这一最新进展产生了有趣的线索,包括A. duranensis的地理起源- 阿根廷北部一个被称为Rio Seco的地区。“古农民玻利维亚迁移有暴露A. duranensis至A. ipaensis植物,” Bertioli博士和共同作者说。科学家还通过跨越两个古老物种并分析七代后代植物的结果来重建这种基因组合并。

这揭示了在后代植物中发生的DNA交换和缺失(消除)的有趣模式,这可能解释了当今商业花生中所见的不同种子大小,形状,颜色和其他特征。

DNA交换是不寻常的,因为它发生在两个贡献的野生物种的两个“亚基因组”之间 - 这可能是由于它们的高度相似性。

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