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新的计算策略发现脑肿瘤缩小分子

计算机建模可识别出第一个抑制抑制驱动胶质母细胞瘤的瞬时细胞事件的分子,并且该分子使小鼠的胶质母细胞瘤缩小-

胶质母细胞瘤(一种恶性脑肿瘤)患者通常在诊断后存活不到15个月。由于没有针对致命疾病的有效治疗方法,加利福尼亚大学圣地亚哥分校的研究人员开发了一种新的计算策略,以寻找可以发展为胶质母细胞瘤药物的分子。在人类胶质母细胞瘤的小鼠模型中,他们发现一种分子将平均肿瘤大小缩小了一半。该研究由Oncotarget发表。

新发现的分子通过将自身楔入两个蛋白质之间的临时界面中而对抗胶质母细胞瘤,这两个蛋白质的结合对于肿瘤的生存和生长至关重要。这项研究是首次证明成功抑制这种称为转录因子的蛋白质。

加州大学圣地亚哥分校摩尔斯癌症中心的科学家,第一作者Igor Tsigelny博士说:“大多数药物靶向蛋白质中的稳定口袋,因此,当我们开始研究时,人们认为不可能抑制两个转录因子之间的瞬时界面。”以及圣地亚哥超级计算机中心和圣地亚哥大学UC的神经科学系。“但是我们解决了这一挑战,并制定了一种新的药物设计策略,我们希望许多其他研究人员将立即开始实施针对相似蛋白质的药物开发,以治疗多种疾病。”

转录因子控制在任何给定时间将哪些基因“打开”或“关闭”。对于大多数人而言,转录因子在高度协调的系统中不断发挥作用。在胶质母细胞瘤中,一种错误的转录因子称为OLIG2,使细胞生长和生存基因在不应出现的情况下保持“开启”状态,从而导致肿瘤迅速生长。

为了起作用,转录因子必须相互结合,两个相互结合并与DNA结合。如果这些关联中的任何一个被破坏,则转录因子被抑制。

在这项研究中,Tsigelny及其团队旨在破坏OLIG2伙伴系统,作为胶质母细胞瘤的潜在治疗方法。根据相关转录因子的已知结构,研究合著者,加州大学圣地亚哥分校的副研究员Valentina Kouznetsova博士开发了一种计算策略,以搜索3D分子结构数据库中那些可能参与两个OLIG2热点的小分子。转录因子。该团队使用了加拿大蒙特利尔化学计算集团生产的分子操作环境(MOE)程序和圣地亚哥超级计算机中心的高性能工作站来进行搜索。

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