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2014年7月24日Nature杂志精选

摘要 : 2014年7月24日Nature杂志本期封面照片为南乔治亚鸟岛一个冰山上的南极软毛海豹(Arctocephalus gazella)。图片由Jaume Forcada提供。本文主要讲的是,随着环境条件继续恶化,南极软毛海豹有了更高的遗传杂合度。本期亮点还有通过劫持增强子发生的肿瘤形成过程、RNA 命运是被随机决定的、Myc的选择性基因调控等等。

 2014年7月24日Nature杂志精选

2014年7月24日Nature杂志本期封面照片为南乔治亚鸟岛一个冰山上的南极软毛海豹(Arctocephalus gazella)。图片由Jaume Forcada提供。本文主要讲的是,随着环境条件继续恶化,南极软毛海豹有了更高的遗传杂合度。本期亮点还有通过劫持增强子发生的肿瘤形成过程、RNA 命运是被随机决定的、Myc的选择性基因调控等等。

封面故事: 南极软毛海豹的环境适应能力

南乔治亚鸟岛一个冰山上的南极软毛海豹(Arctocephalus gazella)到二十世纪初已几乎被捕猎殆尽,但当捕猎海豹的活动停止时其数量又开始恢复了,同时由于食物供应充足,大量这种海豹生存了下来。但软毛海豹面对气候变化尤其脆弱,因为它们生活的地区温度在快速变化,它们相对较长的世代时间也限制了其演化适应能力。现在,对来自南乔治亚的三十年时间的数据所做的一项分析显示,这种海豹数量又在下降,其中雌性数量在2003年和2012年间下降了大约30%。然而,严酷的自然条件也使雌性海豹有了更高的遗传杂合度。虽然这种现象本身并不是一种演化反应,但随着环境条件继续恶化,杂合子优势却有可能帮助维持遗传变异,从而有可能争取时间来让它们通过适应对环境变化做出反应。【全文阅读】

精神分裂症的遗传基础

虽然精神分裂症是一种高度遗传性的疾病,但它复杂的多基因性质却阻碍了试图确定其遗传基础的工作。这篇论文报告了对超过36,000名精神分裂症患者和100,000名对照组实验对象所做的一项全基因组关联研究。该研究在108个位点中识别出128个独立关联,其中83个是新的。它们包括在谷氨酸能神经传递中所涉及的很多基因,这说明存在一个潜在的治疗途径。另外,这些结果也为免疫系统和精神分裂症之间假设存在的联系提供了支持。【全文阅读】

通过劫持增强子发生的肿瘤形成过程

成神经管细胞瘤是一种高度恶性的儿童脑肿瘤。本文作者集中关注两个没有很好表征的亚型,即group 3 和 group 4,它们占儿童病例的绝大多数。他们识别出限于这两个亚型的普遍性基因组结构变异体,并将原致癌基因GFI1 和GFI1B的编码区域与导致致癌基因激活的增强子元素结合了起来。这项研究将“增强子劫持”识别为在一种儿童癌症中驱动致癌基因激活的一个高效机制。【全文阅读】

RNA 命运是被随机决定的

外来体复合物包含两个催化亚单元,它们以分布式(Rrp6)或进行式(Rrp44)降解RNA。以前的结构显示了RNA怎样被引导到Rrp44上,但引导到Rrp6的路径却不清楚。现在,Christopher Lima及同事解决了酵母的一个由十个亚单元组成(缺少Rrp44)、与单链RNA相结合的外来体复合物的晶体结构。Rrp6催化域的位置及RNA 3'端被确定,但更重要的是,RNA取向被发现与来自含 Rrp44的外来体复合物结构的RNA取向相反。这一结果表明,一个RNA的命运可能是根据这个RNA怎样结合到该复合物上所做出的一个随机决定。【全文阅读】

禽流感病毒H10被表征

流感病毒H10N8是感染人类、并致人死亡的一种禽流感病毒的最新例证。Steven Gamblin及同事研究了一种禽流感病毒H10(它与人类分离毒株密切相关)的血凝素的结构和受体结合特点。他们发现,H10病毒已经能够与人类受体相结合,尽管它明显喜好禽类受体。结合到其人类受体上的H10血凝素的结构,还显示了与来自流行性 H1N1 病毒和H7N9病毒的血凝素特点的相似性。作者提出,H10血凝素的受体结合点的突变(这种突变会降低其对禽类受体的亲和力)也许使其能够更容易地在人类之间进行传播,所以应当是监测工作的重点。【全文阅读】

紫外线辐射诱发黑素瘤

流行病学数据已将因接触阳光所患黑素瘤与紫外线辐射(UVR)联系起来,但UVR驱动黑素瘤病情发展的具体目标和机制仍不清楚。在这项研究中,Richard Marais及同事发现,在表达BRAF(V600E)(黑素瘤中最常见的体细胞突变)的小鼠中,与人类轻微晒伤相似的UVR水平会诱导肿瘤抑制因子Trp53发生突变,加快黑素瘤形成。作者还发现,Trp53突变与人类黑素瘤中由UVR诱导的DNA损伤的证据相关。防晒霜能防止鳞状细胞癌的观点已被人们接受,这项研究表明它们也能防止黑素瘤。【全文阅读】

Myc的选择性基因调控

哺乳动物Myc致癌蛋白是与数千个启动子相结合的一种转录因子。关于Myc 功能的两个当前模型提出,它要么是转录的一个基因特异性调控因子,要么是所有活性基因的一个普遍性放大因子。在本期Nature上发表文章的两个小组提供了支持以下观点的证据:Myc 调控特定基因。Arianna Sabò 等人分析了在小鼠的B-细胞淋巴瘤发生过程中Myc的基因组分布及RNA表达特征;Susanne Walz等人对正常细胞和被Myc改变的肿瘤细胞做了对比。虽然这两个小组都发现Myc的表达能导致基因表达的普遍增加,但该效应是间接的。受其他各种转录因子所调制,Myc似乎主要是通过调控特定类别的基因来发挥作用的。【全文阅读】

关联阅读:

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