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巨大的阿尔茨海默氏症数据库旨在存储25000个基因组

美国阿尔茨海默氏病数据存储站点老化遗传学国家研究所(NIAGADS)将开始向研究人员提供大规模的DNA序列数据。目的是使与阿尔茨海默氏症相关的遗传数据提供给尽可能多的研究人员,以加速研究。数据将由宾夕法尼亚大学佩雷​​尔曼医学院的阿尔茨海默氏病基因组学中心(GCAD)处理,所有序列和表型数据将从不同来源进行整合,称为协调化,以便研究人员可以立即进行。开始分析。

NIAGADS和GCAD是潘恩神经变性基因组学中心(PNGC)的一部分,该中心是阿尔茨海默氏病遗传学研究的国家重点。PNGC,NIAGADS和GCAD由病理学和检验医学教授Gerard Schellenberg博士以及病理学和检验医学副教授Li-San Wang博士指导。

Wang说:“阿尔茨海默氏病的遗传发现对于确定治疗发展目标至关重要。”“提供这些数据特别重要,因为目前尚无可预防或改变这种常见和毁灭性疾病病程的治疗方法。”

可获得的信息是5,000个受试者的全基因组序列数据,包括阿尔茨海默氏症和来自欧洲,非洲裔美国人和加勒比海裔的人的认知正常对照。一年之内,将获得另外20,000个主题的数据。这项工作是阿尔茨海默氏病测序计划(ADSP)的一部分,该计划是美国国家老龄研究所(NIA)的一项计划,旨在对多达25,000个个体(包括患有阿尔茨海默氏症和健康对照者)的DNA进行完全测序。所有序列和伴随的表型数据将得到统一,以最大限度地利用数据进行分析。

NIAGADS将分发大型数据文件以进行复杂的分析,这是充分利用此DNA序列资源和其他资源所必需的。当前,这些大型数据集无法通过其他站点获得,包括以前使用的称为基因型和表型数据库(dbGaP)的存储库,该存储库不再接受某些大型序列文件。

NIAGADS的设置具有适当的安全性,可以保护机密数据并将这些大型数据集分发给合格的调查人员。“这个大型测序项目已经加紧提供了一种基于云的替代方法,以将数据存储在dbGaP中以共享大型DNA序列文件,” Schellenberg说。

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