nature

当前位置: Nature » 基因&基因组学 » 正文

Cell Res:中科院逆境中心张蘅研究组和朱健康研究组揭示藜麦耐盐和高营养价值的分子机制

摘要 : 2017年10月10日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Cell Research》杂志在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心张蘅、朱健康研究组和德国维尔茨堡大学Hedrich Rainer研究员合作的一篇研究论文

2017年10月10日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Cell Research》杂志在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心张蘅、朱健康研究组和德国维尔茨堡大学Hedrich Rainer研究员合作的一篇研究论文,论文题为“A high-quality genome assembly of quinoa provides insights into the molecular basis of salt bladder-based salinity tolerance and exceptional nutritional value”。研究通过对藜麦基因组的高质量组装和盐泡细胞的转录组分析揭示了藜麦耐盐和高营养价值的分子机制。邹长松博士是该文章的第一作者,张蘅、朱健康、Hedrich Rainer为共同通讯作者。

藜麦(Chenopodium quinoa)是源自美洲安第斯山脉的一种假谷物,其栽培距今已有7000年以上的历史。近年来藜麦的种植面积在全球不断增加,主要是由于其种子具有极为均衡的营养组成,是美国国家航空与航天局选定的宇航员食物。此外,藜麦具有良好的耐盐特性,虽然它可在低盐环境下正常生长,但在100毫摩尔氯化钠环境下可达到最大生物量,在500毫摩尔氯化钠(海水盐浓度)环境下生物量损失也仅为20-50%,因此人们认为藜麦的种植可增加盐碱地的利用效率,保障未来的粮食安全。

在该研究中,研究人员通过对第二代和第三代高通量测序数据的混合拼装,获得了高质量的藜麦基因组序列,其总长度为1.34Gb,scaffold N50达到1.16 Mb。基因组在距今约430万年前经历过一次全基因组复制,基因组注释发现了54438个蛋白编码基因和192个微RNA(miRNA)基因;参与离子与养分运输、脱落酸动态平衡与信号转导等过程的基因拷贝数增加。而藜麦编码的三个主要种子贮藏蛋白家族的蛋白序列中人类所需的必需氨基酸比例均显著增加,部分解释了藜麦种子高营养价值的原因。

表皮盐泡细胞(epidermal bladder cell, EBC)在约一半的喜盐植物(halophyte)中都存在,也是在藜麦耐盐过程中起重要作用的一类细胞。此前的研究表明盐泡细胞体积可达普通表皮细胞的1000倍左右,其积累的离子浓度可高达1摩尔。通过对盐泡细胞、去除盐泡细胞的叶片和整叶片的转录组比较分析,研究人员发现盐泡细胞具有与藜麦其它组织差异极大的转录组,大量表达在蜡质合成、糖转运等方面起作用的基因。同时研究人员发现了多个盐泡特异的离子转运蛋白基因,这些基因的表达在藜麦受到盐胁迫的情况下表达不发生显著变化,说明其具有组成性活性或受到翻译后水平上的调控。根据这些结果,研究人员提出了从表皮细胞到盐泡细胞的离子转运的分子模型。

 

原文链接:

A high-quality genome assembly of quinoa provides insights into the molecular basis of salt bladder-based salinity tolerance and the exceptional nutritional value

原文摘要:

Chenopodium quinoa is a halophytic pseudocereal crop that is being cultivated in an ever-growing number of countries. Because quinoa is highly resistant to multiple abiotic stresses and its seed has a better nutritional value than any other major cereals, it is regarded as a future crop to ensure global food security. We generated a high-quality genome draft using an inbred line of the quinoa cultivar Real. The quinoa genome experienced one recent genome duplication about 4.3 million years ago, likely reflecting the genome fusion of two Chenopodium parents, in addition to the γ paleohexaploidization reported for most eudicots. The genome is highly repetitive (64.5% repeat content) and contains 54 438 protein-coding genes and 192 microRNA genes, with more than 99.3% having orthologous genes from glycophylic species. Stress tolerance in quinoa is associated with the expansion of genes involved in ion and nutrient transport, ABA homeostasis and signaling, and enhanced basal-level ABA responses. Epidermal salt bladder cells exhibit similar characteristics as trichomes, with a significantly higher expression of genes related to energy import and ABA biosynthesis compared with the leaf lamina. The quinoa genome sequence provides insights into its exceptional nutritional value and the evolution of halophytes, enabling the identification of genes involved in salinity tolerance, and providing the basis for molecular breeding in quinoa.

来源: Cell Research 浏览次数:0

热门文章TOP

RSS订阅 - 填写您的邮件地址,订阅我们的精彩内容: - 网站地图
网站联系电话:020-87540820 备案号:粤ICP备11050685号-8 增值电信业务经营许可证:粤B2-20120479
©2011-2015 生物帮 All rights reserved.