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Sci Rep:农科院杜立新研究团队构建首张不同尾型中国绵羊CNV图谱

摘要 : 2016年6月10日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Scientific Reports》在线发表了中国农业科学院北京畜牧兽医研究所杜立新教授研究团队题为“Genome-wide detection of CNVs in Chinese indigenous sheep with different types of tails using ovine high-density 600K SNP arrays”的研究论文

 2016年6月10日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Scientific Reports》在线发表了中国农业科学院北京畜牧兽医研究所杜立新教授研究团队题为“Genome-wide detection of CNVs in Chinese indigenous sheep with different types of tails using ovine high-density 600K SNP arrays”的研究论文,杜立新教授研究团队通过600K SNP芯片对3种典型尾型的中国绵羊品种构建了全基因组拷贝数变异(CNV)图谱。

中国地方绵羊品种按照尾型可分为脂尾型、脂臀尾和瘦尾型,绵羊尾型是由环境和基因共同决定的复杂性状。我国绵羊品种资源丰富,如何能找到决定绵羊尾部脂肪沉积的基因是育种学家们面临的一项重大课题。该研究结果表明,基因组CNV在决定绵羊尾型差异中发挥了重要作用。

该研究室长期致力于绵羊基因组学和转录组学的研究,此次利用高密度SNP芯片技术及大数据分析方法对3个不同尾型绵羊品种进行研究,共鉴定到493个不同的CNV区域,通过生物信息学分析发现PPARA, RXRA, KLF11, ADD1, FASN, PPP1CA, PDGFA和 PEX6基因影响绵羊尾型性状。该研究成果对今后的绵羊分子育种有推动作用。

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不同尾型中国绵羊CNV图谱

原文链接:

Genome-wide detection of CNVs in Chinese indigenous sheep with different types of tails using ovine high-density 600K SNP arrays

原文摘要:

Chinese indigenous sheep can be classified into three... ...fat-rumped, and thin-tailed sheep, ofwhich the typical breeds are... large-tailed Han sheep, Altay sheep, and Tibetan sheep, respectively. To unravel the... ...underlying the phenotypic differences among Chinese indigenous sheep withtails

来源: Scientific Reports 浏览次数:0

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