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Nat Genet:四川电子科技大学杨正林研究组发表测序新成果

摘要 : 4月18日,2016年4月18日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Nature Genetics》杂志上在线发表了四川成都电子科技大学医学院、中科院成都生物研究所杨正林研究组的最新研究发现,论文称FGD6基因中的一个错义变异提高了息肉状脉络膜血管病变的风险。

 4月18日,2016年4月18日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Nature Genetics》杂志上在线发表了四川成都电子科技大学医学院、中科院成都生物研究所杨正林研究组的最新研究发现,论文称FGD6基因中的一个错义变异提高了息肉状脉络膜血管病变的风险。四川成都电子科技大学医学院杨正林教授是这篇论文的通讯作者。

AMD是老年人失明的主要原因。预计到2020年,AMD患者数量将达到1.96亿人,到2040年这一数字将增加到2.88亿。在西方文章中,AMD晚期阶段通常被分为脉络膜新生血管(CNV,或湿性AMD)和地图状萎缩(或干性AMD)两种类型。然而,在上世纪80年代早期,一种称作为PCV的AMD亚型被确定为不同于典型的CNV形式。

PCV是一种常见的脉络膜血管疾病,吲哚青绿血管造影(ICGA)确诊可见到特征性的血管瘤样扩张的结构,即所谓“息肉状病灶”或/和异常分支血管网。仅在中国,估计就有168万的新生血管性AMD患者,其中近90万人罹患PCV。从临床角度看,PCV和CNV都是因新血管生长及液体积聚所致,均可导致视网膜下出血、色素上皮脱离(PED),及因出血、渗漏及瘢痕组织形成造成的视力丧失。尽管具有这些相似性,出于几个原因人们认为PCV和CNV是湿性AMD的不同亚型。而相比于CNV亚型,当前对于PCV的遗传风险因子仍不是很清楚。

在新研究论文中,研究人员报告称他们首先对一个中国汉族组群进行了外显子组测序,随后在4个独立组群中进行了重复研究,鉴别出FGD6基因中一个罕见的c.986A>G (p.Lys329Arg)变异与PCV(而非CNV)显著相关。他们发现FGD6-Arg329的细胞内定位不同于FGD6-Lys329。在体外,FGD6可以调控促血管生成活性,氧化磷脂可以提高FGD6的表达。在小鼠视网膜中FGD6-Arg329比FGD6-Lys329促进了更加异常的血管生成。研究数据表明,氧化磷脂和FGD6-Arg329有可能协同作用提高了PCV的易感性。

原文链接:

A missense variant in FGD6 confers increased risk of polypoidal choroidal vasculopathy

原文摘要:

Polypoidal choroidal vasculopathy (PCV), a subtype of 'wet' age-related macular degeneration (AMD), constitutes up to 55% of cases of wet AMD in Asian patients. In contrast to the choroidal neovascularization (CNV) subtype, the genetic risk factors for PCV are relatively unknown. Exome sequencing analysis of a Han Chinese cohort followed by replication in four independent cohorts identified a rare c.986A>G (p.Lys329Arg) variant in the FGD6 gene as significantly associated with PCV (P = 2.19 × 10−16, odds ratio (OR) = 2.12) but not with CNV (P = 0.26, OR = 1.13). The intracellular localization of FGD6-Arg329 is distinct from that of FGD6-Lys329. In vitro, FGD6 could regulate proangiogenic activity, and oxidized phospholipids increased expression of FGD6. FGD6-Arg329 promoted more abnormal vessel development in the mouse retina than FGD6-Lys329. Collectively, our data suggest that oxidized phospholipids and FGD6-Arg329 might act synergistically to increase susceptibility to PCV.

来源: Nature Genetics 浏览次数:0

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